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发生洪灾车险的保险公司是会赔偿的，因为洪灾属于自然灾害的一种，车辆损失险当中包括了发生自然灾害给车辆带来的损失，因此只要被保险人购买了车辆损失险，并且保险还在有效期内，保险公司就会予以赔付。需要注意的是，如果在发生洪灾之后，被保险人仍旧强制启动车辆，导致发动机受损，那么保险公司就不会赔偿。
车被洪水冲走怎么赔
1、如果被保险人的车辆被洪水冲走后又找回来，并且车辆有部分受损，那么保险公司就会要求被保险人将车辆送去维修，然后赔偿维修费用，若车辆已经全部受损，那么保险公司会按照车全损的情况进行赔付，具体赔付金额由保险金剩余金额决定；
2、如果被保险人的车辆被洪水冲走并且找不回来，则被保险人需要前往公安机关填写相关的证明，然后再将证明材料交给保险公司，保险公司会依据全损的情况进行赔付。