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医保卡里面的钱分为两个部分，一个是统筹基金，另一个是个人账户，这两部分钱是分开管理的。一般情况下，住院报销，就是从统筹基金里面划出来的。生病住院，花费超过一定金额，就能用上统筹基金的钱；如只是小病没花什么钱，就用个人账户的余额。
医保卡资金的查询方式如下:
一、登录全国医保卡余额查询系统，选择个人所在城市进行查询；
二、注册或者登录当地个人社保查询系统；
三、点击医保个人账户，就可以查询每个月医保卡返钱的明细；
四、还可在支付宝查询。打开手机支付宝，并登录；在主界面找到“城市服务”；然后在“政务”一栏进入社保查询；在授权页面中点击“确认授权”，页面会出现相关信息，点击“医保专栏-个人账户”，填入个人信息后，就能看到医保卡里的资金余额。